Egyptin historiallinen ajanjakso alkoi kolmannen ja neljännen vuosituhannen vaihteessa ennen Kristuksen syntymää. Muinainen kulttuuriperinne, joka oli hyökkääjien ja sisäisten mullistusten vaikutuksen alainen, kesti kristinuskon hyväksymiseen 400-luvulla jKr. Lähes kolmen ja puolen tuhannen vuoden ajan egyptiläisten jumalien luettelo ja tehtävät ovat kokeneet merkittäviä muutoksia. Egyptiläiset jumalat saivat piirteitä ja nimiä, jotka ovat tyypillisiä naapureilleen - assyrialaisille, heettiläisille, hyksosille, helleeneille.
Egyptin yhdistymisen jälkeen yhden hallitsijan vallan alle monet maan yksittäisten alueiden ja heimojen jumalat astuivat yhteiseen panteoniin, mutta useimpia heistä kunnioitettiin vain siinä ympäristössä, josta heidän kulttinsa sai alkunsa. Jotkut jumalat saivat vähitellen yhteisen egyptiläisen merkityksen. Jumalatar Bastet, jolla on kissan pää, syntyi epäilemättä kissojen kunnioittamisesta hiirten viljavarantojen suojelijana. Maataloudella oli v altava rooli Egyptissärooli, toisin kuin esimerkiksi Hellas, joka nousi pääasiassa kaupan ja sotilaallisten valloitusten ansiosta. Antropomorfisille egyptiläisille jumalille annettiin usein eläimen pää, jonka kunnioittamisen perusteella tämä tai tuo kultti syntyi. Esimerkiksi jumalalla Thotilla oli ibiksen pää, jumalatar Sokhmetilla (Sekhmetillä) oli leijonan pää, Anubiksella koiran pää.
Kun tietyt maan alueet nousivat, tapahtui dynastioiden vaihtuminen tai pääkaupungin "muuttaminen" uuteen paikkaan, myös "ensimmäisen vaiheen" egyptiläiset jumalat vaihtuivat. Muinaisen egyptiläisen uskonnon mielenkiintoinen piirre oli lukuisten kosmogonisten myyttien (eli versioiden maailman alkuperästä) läsnäolo, ja jokaisella paikkakunnalla paikallisella jumaluudella oli päärooli tässä vaikeassa asiassa.
Epäilemättä yksikään maa ei tarvinnut Egyptin jumalia niin suuria määriä, joista tuli paikallisen separatismin perusta. Lisäksi lukuisat kultit vaativat suuria aineellisia resursseja, jotka voitiin käyttää paljon suuremmalla hyödyllä maan sisäiseen järjestelyyn, armeijan ylläpitoon ja niin edelleen. Ja joilla oli suuri rikkaus ja vaikutusv alta, pappisklaanit uhkasivat suoraan faaraon yksinv altaa.
Kaikki huomioon ottaen, faarao Amenhotep IV, joka ottaa nimen Akhenaten, esittelee pienen alueellisen jumaluuden Atonin kultin (jumalittu aurinkokiekko) yleiseksi egyptiläiseksi uskonnoksi. Mutta perinteen hitaus oli liian vahva, ja Ehnaton kuolee ennen kuin täytti 40 vuotta. Vakuuttavimman version mukaan hän olimyrkytetty. Totta, vaino ei koskenut perhettä, ja hänen vaimonsa (kuuluisa Nefertiti) jäi eloon monta vuotta miehensä kuoleman jälkeen.
Persian ja myöhemmin Helleenien maan vallankaappauksen jälkeen egyptiläiset jumalat ja jumalattaret alkavat vähitellen menettää entisen vaikutusv altansa, romahtaa. He sulautuvat hyökkääjien jumaliin. Esimerkiksi Aleksanteri Suurta kunnioitettiin Egyptissä Zeus-Amonin, synkreettisen egyptiläis-hellenistisen jumaluuden, poikana.
Kun egyptiläiset jumalat, joiden nimillä oli sekä paikallista että sekalaista alkuperää, alkoivat väistää uutta uskontoa - kristinuskoa, muinaisen egyptiläisen kirjoitusten unohdettuminen alkoi vähitellen. Keisari Konstantinuksen hallituskaudella Egyptin uskonnollisen perinteen viimeinen kantaja kuoli, minkä jälkeen muinaisten egyptiläisten jumalien nimet tunnettiin vuosisatojen ajan vain kreikkalaisten ja roomalaisten historioitsijoiden kirjoituksista. Mutta he molemmat tutustuivat egyptiläiseen kulttuuriin aikana, jolloin se oli jo hiipumassa, ja on epätodennäköistä, että papit olisivat saaneet vieraita (usein aggressiivisia) uskontonsa salaisuuksiin.
Sekä arabitutkijat että eurooppalaiset yrittivät toistuvasti tulkita muinaisia hieroglyfejä, mutta tuloksetta. Ja vasta 1800-luvun alussa loistava kielitieteilijä Francois Champollion onnistui löytämään avaimen egyptiläisten tekstien tulkitsemiseen. Siitä hetkestä lähtien muinaisen Egyptin historian ja kulttuurin tutkimisen moderni aikakausi alkoi.
